侯庆振 副研究员
发布者： 发表时间：2020-07-27 来源：
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国家健康医疗大数据研究院 生物信息大数据中心
山东大学青年学者未来计划
中华预防医学会肾脏病预防与控制专业委员会 专委
联系方式：邮箱 houqingzhen@sdu.edu.cn；手机 18853 122360
个人网站：https://faculty.sdu.edu.cn/houqingzhen/
研究方向和领域
生物信息学；蛋白质功能与结构预测；机器学习/深度学习方法分析解决生物学医学问题；单细胞转录组分析
主要致力于挖掘生物医学大数据的生物学意义，分析生物大分子结构和功能的关联。研究方向包括利用机器学习以及深度学习的方法，发展预测蛋白质结构功能的算法及工具；整合表观基因组学，转录组学和蛋白组学进行跨组学分析，探索疾病的分子机制；聚焦单细胞转录组测序数据分析，寻找细胞间异质性和差异表达基因等。近年来在生物信息学领域国际期刊发表论文多篇，其中在计算生物学一区TOP期刊Bioinformatics上发表第一作者论文5篇，同时担任Bioinformatics, PeerJ, Computational Biology and Chemistry 等多个杂志审稿人。
教育经历
2009.06-2011.06 发育生物学 武汉大学 硕士 导师：赵洁教授
2012.01-2016.12 生物信息学 荷兰阿姆斯特丹自由大学（Vrije Universiteit Amsterdam）博士
导师：Prof. Jaap Heringa; K. Anton Feenstra
工作经历
2017.01-2019.12 结构生物信息学 比利时布鲁塞尔自由大学（Université libre de Bruxelles）博士后
导师：Prof. Marianne Rooman
2020.03- 山东大学公共卫生学院 副研究员
近五年代表性著作（截至2021年7月）：
1. Hou, Q., Stringer, B., Waury, K., Capel, H., Haydarlou, R., Xue, F., Abeln, S., Heringa, J., & Feenstra, A., (2021). SeRenDIP-CE: Sequence-based Interface Prediction for Conformational Epitopes. Bioinformatics(Accepted). [数学与计算生物学1区，TOP期刊]
2. Hou, Q., Pucci, F., Ancien, F., Kwasigroch, J. M., Bourgeas, R., & Rooman, M. (2021). SWOTein: A structure-based approach to predict stability Strengths and Weaknesses of prOTEINs. Bioinformatics, btab034.[数学与计算生物学1区，TOP期刊]
3. Hou, Q., Kwasigroch, J. M., Rooman, M., & Pucci, F. (2020). SOLart: a structure-based method to predict protein solubility and aggregation.Bioinformatics,36(5), 1445-1452.[数学与计算生物学1区，TOP期刊]
4. Hou, Q., De Geest, P. F., Griffioen, C. J., Abeln, S., Heringa, J., & Feenstra, K. A. (2019). SeRenDIP: SEquential REmasteriNg to DerIve profiles for fast and accurate predictions of PPI interface positions. Bioinformatics, 35(22), 4794-4796.[数学与计算生物学1区，TOP期刊]
5. Hou, Q., De Geest, P. F., Vranken, W. F., Heringa, J., & Feenstra, K. A. (2017). Seeing the trees through the forest: sequence-based homo-and heteromeric protein-protein interaction sites prediction using random forest. Bioinformatics, 33(10),