一九四七年十月，杜斌丞被杀害之后，杨明轩向新华社记者发表谈话，痛斥蒋介石、胡宗南的罪行，号召西北民主同盟盟员团结起来，在中国共产党领导下，为解放大西北贡献力量，以告慰杜斌丞烈士的英灵。一九四八年十月七日，陕甘宁边区各界在延安隆重举行悼念杜斌丞殉难一周年大会，杨明轩在悼词中满怀深情地说： “余与斌丞先生初则同学北平高师，继则共事陕西教育，致力于西北民主革命运动，志同道合，早投契交，大节所在，始终弗移。”充分表达了他和杜斌丞先生之间的革命情谊。
杨明轩在延安期间，还参与了陕甘宁边区政府的领导工作;胡宗南进攻延安之后，又随边区政府转战陕北。一九四八年二月， 他被任命为陕甘宁边区政府副主席。 同年四月，我军收复延安;十二月，延安地区的民主同盟成员召开大会，成立了民主同盟西北临时工作委员会，他被推选为主任委员，“为联络国统区民盟地下工作同志，发展地方武装，迎接解放，做了大量工作。”①他经常教育干部“必须认真执行党的路线、政策”; “我们的工作态度必须是谨慎严肃。不可自以为是，盛气凌人。同时必须有明确的阶级观点”;“每个干部，要以身作则，守法奉公，反对个人享乐思想和贪污腐化行为。”②杨明轩在解放战争时期，为总结西北人民革命斗争史，推动西北地区民主爱国运动，争取国民党统治区知识分子和发展文化教育事业，做出了重要贡献。
一九四九年五月二十日，西安解放。二十四日，西安市军管会成立，贺龙为主任，杨明轩被任命为委员。九月，他作为西北解放区代表，参加中国人民政治协商会议和第一次全体委员会议。中华人民共和国成立后，他担任西北军政委员会委员兼文教委员会主任委员、党组书记，西北行政委员会副主席等职。解放初期，西安市情况比较复杂混乱，他经常风尘仆仆，深入一些学校、文化团体，召开各种座谈会，调查研究。他正确执行党中央关于文化教育工作的方针、政策，在团结、教育、改造知识分子等方面，做了大量工作。他还对西安地区一些民盟成员做了大量细致的思想工作，在此基础上恢复民盟的活动。一九五○年八月，中国民主同盟西北地区第一次盟员代表大会于西安召开，他在会上做了总结报告，回顾了民盟西北总支部的战斗历程，肯定了成绩，提出了今后的任务。会上，杨明轩被选为中国民主同盟西北工作委员会主任委员。一九五三年，他率领西北各界人士代表团赴朝鲜慰问中国人民志愿军。回国后，他认真进行传达，号召各界人士，特别是教育界、民主党派成员，要努力学习中国人民志愿军英勇杀敌的战斗精神，做好各项工作，为抗美援朝作出应有的贡献。
杨明轩满怀热情，投身于社会主义革命和建设之中，得到党和人民的充分信任。他当选为第一、二、三届全国人民代表大会代表，并当选为委员、常务委员、副委员长。自一九四九年起，他一直担任民盟西北总支部负责人，民盟中央常委。一九五八年十二月，在民盟全国第三次代表大会上，被选为副主席。一九六三年，沈钧儒逝世后，他继任中国民主同盟中央主席。此外，他还担任过《光明日报》社社长，中央社会主义学院副院长等职。他还十分重视文字改革工作，对我国文字改革工作起了重要的推动作用。
一九六七年八月二十二日，杨明轩在北京病逝，终年七十六岁。