陈恩担任的主要社会职务有：国台办特约研究员、全国台湾研究会理事、全国港澳研究会理事、广东省孙中山基金会理事、广东省台湾研究会理事、广东经济学会理事、广东高校统战研究会常务理事、广东省港澳经济研究会副秘书长、广东省泛珠三角合作研究会副秘书长、广东省县域经济研究会常务理事、中国贸促会广州分会特邀顾问、厦门大学台湾研究院“海峡两岸协同创新中心”和广东省委统战部统战研究基地专家组成员、中山大学《粤港澳合作研究院》国家智库专家组成员、汕头大学粤台企业合作研究院学术委员会委员等。