李复几晚年经济拮据，一人的工资要担负多个子女的教育生活费用，为延迟退休只好隐瞒5岁的年龄以继续工作，逝世前夕，还兼任私立旭川中学的英文教员。据其子女回忆，他晚年精神状态不佳，工作之余就沉默寡言，与以前判若两人。1947年9月16日，66岁的李复几在四川自贡病逝，死后竟然无钱安葬，在同事们的帮助下，才购得棺木，并按照当地的习俗，被抬上高山。在国弱民贫的时代，中国第一位物理学博士的临终遭遇令人唏嘘不已。李夫人邢珊文后从四川返回上海，1952年去世。