1983年，吴征镒被选为美国植物学会外籍终身会员，1985年，被瑞典皇家植物地理学会选为名誉会员，1987年选为前苏联植物学会通讯会员，1997年被选为世界自然保护协会理事（ISCN），2001年为国际植物分类学会会员。