含氟物质在国防、核能、医药、材料等关键领域中发挥着不可替代的重要作用。胡金波自2005年入选中科院“百人计划”，加入上海有机所开展独立研究工作以来，以国家重大需求和学科前沿为导向，开展氟化学基础和应用基础研究。他首次提出亲核氟烷基化反应中的“负氟效应”概念，并带领团队深入研究了对“负氟效应”的系列调控策略，发展了多个原创性氟化学合成试剂和反应，其中两个试剂被国内外同行广泛称为“胡试剂（Hu Reagent）”。多个试剂已在全球商品化销售，被国际同行成功使用超过150次，并被美国辉瑞制药公司（Pfizer）成功应用于治疗肺癌药物的合成中。胡金波还带领团队积极开展面向国家重大需求的特种含氟材料的研制，利用所发展的新型锂同位素萃取剂材料，首次采用有机萃取法对锂同位素进行高丰度富集分离，锂-7同位素的丰度高于99.99%, 为我国第四代先进核能钍基熔盐堆的发展提供了关键同位素材料的制备技术。