1918年5月7日，王德宝出生于苏北平原泰兴县黄桥镇。父亲王嵩樵是个读书人，对子女要求、教育很严格。王德宝从小受到良好的家庭教育。
王德宝的祖父生有四子一女，四子为集成、宝山、松樵、养源，一女名晶清。王德宝的父亲王松樵排行老三，曾当过江苏省参议员，他和四弟养源在东大街合开了一个酱园店，称“泗记王永盛”，“泗”在这里是三四两房合伙的意思。在很长一段时间里，“王永盛”垄断了黄桥的酱园业，在方圆几十里内很有名气。
1923年，他4岁刚过就开始跟随吴铁珊先生读私塾。
1929年，王德宝弃私塾念小学插班入黄桥镇小学5年级下学期。
1930年，小学毕业考入南通崇敬中学。
1936年，中学毕业，报考中央大学和浙江大学，均获录取，王德宝选择了距家较近的南京中央大学。
1937年，日本侵略军轰炸上海，危及南京，中央大学内迁到重庆，他随校内迁，1940年毕业于重庆中央大学，留校任助教。由于处于抗日战争的艰难时期，生活、工作条件都非常困难，除安排学生实验课及主动旁听一些课程，增加知识之外，无法开展研究工作。
1943年，他到成都中央大学医学院生化科，在郑集教授指导下进行植物蛋白质营养价值的比较研究，在《中国化学学会》杂志上发表了数篇论文，1945年晋升为讲师。
抗日战争胜利后，中央大学在川各院系回迁南京，王德宝于1946年夏回到南京。不久，教育部招考公费留美学生，他被录取，学习制糖专业。
1946年，考取公费留学美国
1947年初，王德宝入美国路易斯安那州立大学，学习制糖专业。由于成绩优异，被选为美国化学会路易斯安那州立大学分会荣誉化学会员，1948年转入华盛顿大学医学院生化系，在1947年诺贝尔生理学和医学奖得主CCori 教授的实验室学习生化。在资深教授JOLampen指导下，他完成了去美国后的第一篇论文《胞苷的酶促脱氨》，获得硕士学位。
1949年，美国政府停止发给留美学生经费，王德宝在美费用遇到困难。这时恰巧Lampen接受克里夫兰城西部保留地大学聘请任教，王德宝随Lampen去保留地大学任助教，继续从事核酸代谢的研究工作。他从戊糖乳杆菌中找到了能分解腺苷、胞苷和黄苷的核苷酶，并从土壤中分离出一种能利用尿嘧啶作为碳源氧化尿嘧啶成巴比妥酸的细菌，1951年获得博士学位。
1949年和1951年，先后获美国华盛顿大学硕士和美国西部保留地大学博士学位。
1951～1954年，在美国约翰·霍普金斯大学进修。
1951年9月，王德宝决定回国工作，不料轮船行至檀香山后遭到美国政府阻挠，滞留檀香山。为了维持生活和研究工作，他又到美国约翰·霍普金斯大学任职，和NOKaplan一起解决了辅酶A中第三个磷酸根的位置，并发表了直接从辅酶Ⅰ制备辅酶Ⅱ的酶促法。当时辅酶Ⅱ的价格非常昂贵，酶促方法生产辅酶Ⅱ的论文发表后，为世界各大药厂采用，辅酶Ⅱ的价格大幅度下降，而且酶促法几十年一直被采用。
1954年底，王德宝回到祖国，分配到上海中国科学院生理生化研究所工作。在相当困难的情况下，创建了核酸研究组。
1958年，生理生化研究所划分为生理所和生物化学所两个研究所，王德宝在中国科学院上海生物化学研究所工作，并建立了中国第一个核酸研究室。
在20世纪50年代，关于核酸的研究工作，世界有名望的实验室都把重点集中在tRNA(或称sRNA)的分离、纯化和结构的研究方面，这个领域成为各国科学家研究的热点。在国家、研究所、研究室非常困难的条件下，王德宝带领同仁开展了对tRNA的分离、纯化、结构和功能的系统研究工作。他们团结一致、克服困难、勤奋工作、勇于探索、努力攀登，做出了有国际水平的工作，发表了大量有重要影响的学术论文。美国《实验生物学联合会会议录》第27卷第6期和1968年美国《核酸研究和分子生物学进展》第8卷中都曾对他们的工作做了长篇介绍和高度评价，在《中国近期的核酸研究》一文中写道：“上海王氏小组在核糖核酸的研究方面达到了和西方科学界同样的水平。”
1968年，中国开始进行国际领先水平的酵母丙氨酸转移核糖核酸人工全合成的研究工作。
1970年，王德宝参加该工作，负责人工合成酵母丙氨酸tRNA的工作。这项工作是由中国科学院上海和北京的4个研究所、北京大学和上海一个试剂厂协作于1981年完成的。由于“文革”的干扰，这项工作在1978年之前进展缓慢，只制备了一个8核苷7磷酸。
1978年重新做了调整，采纳王德宝的建议成立了3个会战组以解决关键性问题，他先后被任命为合成会战组组长和以后协调不同会战组之间进度的会战指挥组组长，在3年多一点的时间里，合成了6个大片段寡核苷酸(长度分别为13、9、13、10、12和19核苷酸)，两个半分子(分别为35和41核苷酸)和76核苷酸的整分子，并证明他们的合成产品具有和天然产物相同的组成(含有全部四种普通核苷酸和七种修饰核苷酸)和结构，并具备全部生