徐琪，又名徐世经。1928年生于山东省邹平县长白乡（现孙镇乡）王伍村，1936年入本村小学接受启蒙教育。当年芦沟桥事变爆发，家乡沦为区，学校停办，之后学习时续时断。1944年冬于长白乡小学毕业，后转周村私立光被中学小学部续读，暑假升入初中班，于1947年初中毕业，同年考入济南第一后期师范学习。1948年考取山东农学院农化系土壤肥料专业就读。1952年大学毕业后统配到中国科学院土壤研究所第四研究组（现土壤地理研究室）工作，先后任研究实习员、助理研究员、副研究员（1980）、研究员（1986），1986年被评为博士生导师。
参加工作之后即被派往公主岭参加东北荒地考察队的分析工作，并协助宋达泉筹建中国科学院林业土壤研究所（现应用生态所）。1953年病休，协助中国土壤学会出版《土壤通讯》。1956 年参加马溶之与文振旺主持的土壤区划研究赴内蒙古地区进行土壤调查。1958年参加甘青队荒地勘查与太湖地区稻麦丰产经验总结，在常熟白茆蹲点，旋即参加土壤普查。1964年在江苏省农业区划委员会领导下参加土壤区划研究，在完成省级区划之后又进行县级区划研究，直到“文化大革命”而中止，该项成果获江苏省科技大会表彰。
1970年参加江苏省徐淮旱改水工作，在铜山县张集蹲点，1973-1974年参加黑龙江省荒地勘查工作，1974年底参加《中国土壤》的编写，直至1976年定稿。
1979年后，土壤研究所进行室组调整，被任命为稻土生态组副组长，后改为土壤生态研究室，并任该研究室主任（1986-1992），期间还兼任中国科学院南京土壤研究所学术委员会委员、土壤圈物质循环研究所开放实验室研究员。
1983年被选为中国生态学会理事（第二届）与常务理事（第三、四届），江苏省生态学会常务理事与副理事长，中国生态学会农业生态专业委员会主任，中国土壤学会土壤肥力专业委员会主任，江苏省土壤学会常务理事，以及《生态学报》、《土壤通报》、《生态学杂志》、《生态农业研究》、《长江流域资源与环境》等杂志的编委。
技术成就
我国有大面积的白浆土，估计面积约527万公顷，是主要的低产土壤。过去对白浆土的形成过程、低产原因及其改良措施都缺乏系统的研究，因而影响了白浆土的生产力。徐琪与有关合作者一起对白浆土与白浆化土壤分别处于还原脱（铁）膜、粘粒淋淀与粘土矿物蚀变等不同阶段，明确了白浆土与白浆化土壤在分类体系中的地位，为改良利用白浆土与白浆化土壤提供了理论依据。集多年研究成果，与曾昭顺等合著《中国白浆土》专著，于1997年由科学出版社出版。
中国有五千年的耕作历史，特别是水稻的生产在我国农业生产中占有极其重要的地位。有关水稻土的形成与分类，过去我国学者长期引用日本学者提出的“三水”与“三源”分类原则，这些分类系统不能概括我国水稻土的多样性。徐琪通过系统研究太湖地区水稻土的形成过程，提出了“五水”分类系统，即爽水、侧渗、滞水、囊水与漏水水稻土。它不仅可以说明不同水分状况下水稻土形成过程的差异，而且也为治水改土和稻麦丰产提供了理论依据。他进而提出了土壤基础肥力与熟制运筹的关系，为实现水稻的高产稳产低耗提供了依据。他撰写的《中国太湖地区水稻土》专著，获中国科学院科技成果二等奖，“太湖地区高产土壤的培育和合理施肥”（“六五”攻关课题）获国家科技进步二等奖和中国科学院科技进步二等奖。
土壤生态学是一门新兴的交叉学科，徐琪于80年代初在我国率先进行了土壤生态学的研究，尤其是稻田生态系统的研究，在国内外有很大影响。他领导的研究组首次运用分室模型研究了稻田生态系统各分室之间的养分循环规律；探讨了不同施肥系统条件下养分循环的特征、养分循环与环境的变化、养分循环与农作物的高产优质等的关系；比较了有机肥、化肥及其混合施用对稻田生态系统的影响，为提高稻田土壤养分的有效利用、提高农作物的产量与质量提供了理论依据。通过20多年的研究，完成了我国第一部《中国稻田生态系统》专著。有关成果得到国际土壤学会前主席田中明教授的盛赞，在国内外产生了重大影响。
在国内较早进行了草原土壤生态系统营养物质循环的研究，并根据这种生态系统的特点，提出了草原土壤生态系统中养分循环与草场退化的关系，为我国草场建设及提高生产力提供了理论依据。
同时进行了基塘系统的养分循环与能量转化的研究。提出基塘系统的水泥界面是控制养分循环的核心，并影响基塘系统的生态环境。我国著名生态学家马世骏先生曾称“基塘系统—泥界面养分循环研究把我国基塘系统的研究向前推进了一大步”。
三峡工程是举世瞩目的大型水利工程，将产生巨大的社会与经济效益，但不容置疑也将对三峡库区乃至整个长江流域的生态环境产生重要的影响。徐琪从1984年起，承担了国家科委重点攻关项目“三峡工程对生态环境影响及对策研究”，就三峡工程对库区移民环境容量、中游土壤潜育化、沼泽化潜在威胁及河口地区盐渍化趋势进行