時钧于1938年5月回到灾难深重的祖国。6月抵达汉口，经清华同学推荐，在国民政府军政部化学兵队任教官。当时日本侵略军进攻武汉，时钧自长沙出发，一路长途跋涉，经湘西、贵州，并于1939年2月到达重庆，从此开始了他长达一生的执教生涯。
年仅27岁的时钧，先后受聘在中央工专、中央大学、重庆大学、兵工大学及动力油料厂研究生班任教，主讲“物理化学”、“化工计算”、“化工原理”、“工业化学”、“化工热力学”、“化工经济”等多门课程。抗日战争胜利后，在1946年时钧回到南京，任中央大学教授、化工系系主任，同时兼任重庆大学化工系教授和系主任。时钧才华横溢、学识渊博，授课时常常广征博引，又因条理分明、深入浅出的授课风格，深受学生的敬重与爱戴。
1952年，新中国高等院校调整，时钧任南京工学院化工系教授、系主任，同时受命创建我国第一个硅酸盐专业。他以前苏联的教学计划为蓝本，培养出了我国第一批水泥专业的大学本科毕业生和研究生。1956年秋，时钧与汪德熙、汪家鼎等教授联名上书高教部，建议在化工系设立化学工程专业。1957年初，高教部同意试办。同年4月底，高教部在北京召集有关会议，制订化学工程专业教学计划，由时钧任组长。当年暑假，天津大学和华东化工学院开始招生。
可以这么说，时钧是我国水泥专业、化学工程专业的创导者和开拓者，他对吸收、干燥技术、膜分离技术和化工热力学等方面的研究有着非常重要的贡献。1956年春，时钧作为科学技术专家，参加了周恩来总理亲自主持的我国《1956-1967年科学技术发展远景规划纲要(草案)》的制订工作，和严东生等共同负责制订硅酸盐组的课题;后来他又同汪德熙、张建侯、余国琮等共同拟订了第五十六项(基础研究)中有关化学工程学科发展的规划。1957年春，时钧被国家科委委任为硅酸盐组副组长。
新中国成立不久，时钧又正当盛年，可正要大展才干大干一场，因为一个众所周知的原因，时钧又历经了二十余年的坎坷人生路程。在逆境中，不论是劳动锻炼，还是在实验室工作，他都兢兢业业，埋头工作，尽心尽力，严于职守。而且在异常艰难的环境中和极其简陋的条件下，他还进行了湍流塔试验和膜分离技术的研究。
一生诲人不倦，亲手培养16名院士
“文革”给高等教育造成了巨大创伤，化学工程专业未能幸免，时钧也受到了巨大的冲击。可正是这位十分爱惜人才的大教授，即便是在自己沦落之时，都不忘提携后辈。当时，有一位姓肖的实验员非常聪明好学，时钧见他很有上进心，于是有意辅导他做进一步的深造，并且亲自还教他学会英语。这个年轻人后来进步很大，从实验员起步，直至当上了高级工程师。
1978年以后，时钧终于得到平反，而此时，他已是六十多岁的老人。只因感觉时光宝贵，他无暇顾及一切恩怨，只是埋头工作，力尽所能挽回"文革"造成的损失。当时，他在学校一连开设了《化工原理》、《化工热力学》、《单元操作选论》等课程并重登讲台，有时甚至不辞辛苦连上四节课。
从1979年起，时钧着手重建南京化工学院化学工程系，并担负起系主任的繁重任务。在他主持带领下，学校建成了化学工程博士点，并建成了具有一定规模的化学工程研究所。进入本世纪以来，他还每年招收1-2名博士研究生，并坚持亲自为学生审阅论文、主持答辩。除此之外，有关科研项目申报、学科建设规划、学校发展方向等，时老也都一一把关。
令他身边工作人员最敬佩的一点就是，老人气度非凡，即便是面对曾在文革中冲击过自己的人，他非但不记仇，而且还在适当的时候，给与他们所需要的帮助，帮助他们完成人生中重要的飞跃。
六十多年来，他在化工高等教育辛勤耕耘，弟子遍布世界各地，有些已是蜚声中外的专家、学者，在化工、炼油、冶金、建材、机械、医药等领域做出了卓越的贡献，其中还包括16位两院院士。
1998年，时钧主持完成了《化学工程手册》新版以及《大百科全书》化工卷的编撰工作。他在担任《中国大百科全书·化工卷》常务副主编时，为编纂这部巨著倾注了大量心血，不仅肩负着繁重的组织领导工作，还亲自撰写修改了若干重要条目，有的甚至五易其稿。其中，他还亲手撰写了《综论》中的若干篇章，并主持翻译了《传质学》以及《流态化工程》和《翅管换热器设计计算》等书。
院士有异于常人的晚年生活
90岁如愿以偿加入中国共产党
南京化工大学副研究馆员王莎莎女士受学校委托，自1996年开始一直在时钧身边工作，直至院士去世。在接受本报记者采访时，王莎莎用了“慈祥儒雅、豁达大度”这八个字来概述她心中的“时先生”。